在国务院新闻办“落实创新驱动发展战略”的新闻发布会上，万钢对媒体称，科研项目经费管理甚至出现过“恶性问题”：一位知名的环境领域专家和一个重要省份的科技厅长涉嫌违法违纪，正在接受审查。
万钢说，“出现这些问题，我感到很愤怒，也很痛心，更感到十分错愕、愤怒。我们用的钱都是纳税人的钱，我们绝不容忍这些现象。” 2012年，国家财政科学技术支出为5600.1亿元，占当年国家财政支出的比重为4.45%。
万钢这一讲话的背景是，9月30日上午，中共中央政治局以实施创新驱动发展战略为题在中关村(000931,股吧)举行第九次集体学习。中共中央总书记习近平在主持学习时强调，实施创新驱动发展战略“决定着中华民族前途命运”。
去年召开的中共十八大更是作出了“实施创新驱动发展战略”的重大部署。根据这一战略，国家一方面出台了一系列战略性新兴产业发展规划；另一方面成立了以国务院副总理刘延东为组长、跨26个部门的科技改革和创新体系建设领导小组，并出台多项改革文件。
然而，随着国家创新驱动战略的实施，各行各业、各部门、各个地方，包括企业在内对科技加大投入的同时，对中国科研经费资助体系的批评一直不绝如缕。
“科技项目经费管理改革一直是我们的重点任务，也一直在努力解决”。万钢表示，但“为什么还会出现这些问题？为什么大家还不满意呢？”
万钢认为，原因是一个根本问题没有解决——科技人员和管理人员是坐在同一条船上共同摇桨的，“如果一个方面使劲，那个方面不使劲，这个船只能在原地打转”。
他为此开出的药方是增加透明度。
目前，科技部正在建立国家科技报告制度。“就是要把结题验收后的项目放到网上，让本行业、本专业、本领域、本产业的同志们都来看他做得怎么样，好的可以进行技术转移。”万钢解释说。
今年年底，将从科技部开始，建立一个透明的、各部门在一起的科研信息部署平台，每年公众可以在网上按照自己的专业、自己所在单位查到各个部门立了什么项目，支持了哪些课题。此外，科技部还将加强经费巡视，建章立制。
“当前最重要的工作，是要做好科技项目公开透明的、跨部门甚至跨地方的信息平台和经费监管体系建设，建立国家科技报告制度和国家创新调查制度，推动我国科技资源的积累、完善和开放共享。”万钢说。
他还提出设想，以后的科研课题经费使用情况至少要在本课题或本单位内部公开，对于科研经费“竞争”中落选的单位要告知专家评审结果供其改进，同时调整经费比例，增加基础前沿方面稳定长期的支持。
